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rna測(cè)序，為什么rna測(cè)序還需分析可變剪接體

來(lái)源：整理時(shí)間：2023-08-23 01:23:36 編輯：智能門(mén)戶手機(jī)版

本文目錄一覽

1，為什么rna測(cè)序還需分析可變剪接體
2，deep RNA sequencing是什么意思
3，16Sr RNA基因擴(kuò)增后的該怎么測(cè)序
4，RNA測(cè)序與整個(gè)基因組測(cè)序相比有什么優(yōu)勢(shì)
5，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和RNAseq的區(qū)別是什么
6，StrandSpecific RNASeq Analysis

1，為什么rna測(cè)序還需分析可變剪接體

因?yàn)镽NA測(cè)序其實(shí)想得到的是mRNA的信息,但是總RNA當(dāng)中絕大部分都是核糖體RNA,這些RNA的信息是無(wú)用的,所以需要去掉核糖體RNA,然后,將mRNA富集之后去做測(cè)序.

能夠?qū)na序列數(shù)據(jù)進(jìn)行分析的新方法可以讓我們從頭開(kāi)始構(gòu)建轉(zhuǎn)錄組。對(duì)rna進(jìn)行測(cè)序一直以來(lái)都被認(rèn)為是一種發(fā)現(xiàn)基因的有效方法,而且這種方法還被認(rèn)為是對(duì)

為什么rna測(cè)序還需分析可變剪接體

2，deep RNA sequencing是什么意思

深度RNA測(cè)序。指高精度、多重的的對(duì)核苷酸序列進(jìn)行測(cè)序。

RNA深化程序

亞硫酸氫鈉測(cè)序法(bisulfite genomic sequencing) 直接測(cè)序法是建立在msp基礎(chǔ)上進(jìn)一步深入研究cpg島各個(gè)位點(diǎn)甲基化情況的方法。重亞硫酸鹽使dna中未發(fā)生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉(zhuǎn)變成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變，行pcr擴(kuò)增(引物設(shè)計(jì)時(shí)盡量

deep RNA sequencing是什么意思

3，16Sr RNA基因擴(kuò)增后的該怎么測(cè)序

這個(gè)需要利用測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序，您可以選擇測(cè)序公司給錢(qián)就行了。測(cè)16S主要是想對(duì)混合菌群內(nèi)的菌株進(jìn)行分類，可以選擇測(cè)V3區(qū)或者V6區(qū)。測(cè)序公司會(huì)根據(jù)您選擇測(cè)的區(qū)域進(jìn)行基因測(cè)序，然后將得到的序列與已經(jīng)發(fā)表的微生物序列進(jìn)行比對(duì)，因?yàn)閂3和V6區(qū)都屬于保守區(qū)段，所以能夠比對(duì)上的序列就可以算作您的樣品中有該種菌。16S測(cè)序目前做的公司有華大基因，美吉生物等，這個(gè)兩家做的比較好。每個(gè)樣品價(jià)格大概在3000元的樣子。您在測(cè)序之前可以聯(lián)系測(cè)序公司的銷售，然后詢問(wèn)價(jià)格，索取他們的結(jié)題報(bào)告模板進(jìn)行參考，知道您能得到什么樣的結(jié)果再進(jìn)行選擇。

16Sr RNA基因擴(kuò)增后的該怎么測(cè)序

4，RNA測(cè)序與整個(gè)基因組測(cè)序相比有什么優(yōu)勢(shì)

RNA測(cè)序也就是所謂的RNA-seq，通常指的是轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，只測(cè)細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄本。只有基因組中被轉(zhuǎn)錄出來(lái)的那部分能測(cè)到。通常用于尋找差異表達(dá)基因以及發(fā)現(xiàn)新基因。而基因組測(cè)序是整個(gè)基因組都測(cè)，不管轉(zhuǎn)錄不轉(zhuǎn)錄，通常用于基因組組裝，重測(cè)序進(jìn)行基因分型等。這是根本不同的兩個(gè)東西，一個(gè)是測(cè)轉(zhuǎn)錄組，一個(gè)是測(cè)基因組，它們的不同就是轉(zhuǎn)錄組和基因組的不同。至于優(yōu)勢(shì)，根據(jù)自己的目的來(lái)判斷吧。歡迎追問(wèn)。

朋友你好！雖然rna種類多樣，但我們拿來(lái)測(cè)序的一般是信使rna即mrna。眾所周知mrna是核內(nèi)基因表達(dá)時(shí)通過(guò)轉(zhuǎn)錄修飾后的產(chǎn)物，其直接通過(guò)招募核糖體結(jié)合trna進(jìn)行翻譯表達(dá)。因此相比于dna，mrna上既沒(méi)有復(fù)雜龐大的非表達(dá)dna部分（這類dna元件不會(huì)轉(zhuǎn)錄出mrna）,也不含內(nèi)含子等表達(dá)基因的冗余部分，可以說(shuō)mrna是最接近所表達(dá)的蛋白產(chǎn)物的模板了。因此rna測(cè)序直觀，簡(jiǎn)潔，高效的反映了某一時(shí)刻生物體蛋白質(zhì)的表達(dá)水平，具有簡(jiǎn)潔性和時(shí)效性。希望幫到你，歡迎追問(wèn)~

5，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和RNAseq的區(qū)別是什么

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和RNA-seq是一樣的，他們的關(guān)系如下：1. 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的方法很多，而RNA-seq是當(dāng)前轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的一種測(cè)序方法，又稱為二代測(cè)序，包括454，solexa等。2. RNA-seq即轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，就是把mRNA,smallRNA,and NONcoding RNA等或者其中一些用高通量測(cè)序技術(shù)把它們的序列測(cè)出來(lái)。反映出它們的表達(dá)水平。 3. 數(shù)字基因表達(dá)譜升級(jí)版（RNA-Seq）是用來(lái)研究某一生物對(duì)象在特定生物過(guò)程中基因表達(dá)差異的技術(shù)。該技術(shù)結(jié)合了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序建庫(kù)的實(shí)驗(yàn)方法與數(shù)字基因表達(dá)譜（Digital Gene Expression Tag Profiling, DGE）的信息分析手段，可廣泛應(yīng)用于生理調(diào)控、農(nóng)業(yè)性狀、生物標(biāo)記、環(huán)境改造、疾病機(jī)制和藥物篩選等領(lǐng)域。

兩者是同一個(gè)概念。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序亦稱rna-seq（rna sequencing），是指利用第二代高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行cdna測(cè)序，全面快速地獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本。相對(duì)于傳統(tǒng)芯片而言，轉(zhuǎn)錄組測(cè)序無(wú)需預(yù)先設(shè)計(jì)探針，即可對(duì)任意物種的任意細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行檢測(cè)，能夠提供更精確的數(shù)字化信號(hào)，更高的檢測(cè)通量以及更廣泛的檢測(cè)范圍，是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大工具。

6，StrandSpecific RNASeq Analysis

strand-specific這個(gè)翻譯成鏈特異性，鏈特異性RNA-Seq分析，鏈特異性就是因?yàn)榻◣?kù)測(cè)序時(shí)mRNA反轉(zhuǎn)錄為雙鏈cDNA文庫(kù)，可以確定轉(zhuǎn)錄本來(lái)自正鏈還是負(fù)鏈，更好的準(zhǔn)確度獲取基因結(jié)構(gòu)。具體說(shuō)就是在建庫(kù)合成第二鏈cDNA時(shí)吧dTTP換成dUTP然后加上接頭，降級(jí)第二鏈

是一種保留方向的RNA測(cè)序技術(shù)，是二代測(cè)序中的一個(gè)比較新的技術(shù)，nature上有一些文章專門(mén)寫(xiě)這個(gè)，你可以看看，也推薦你看看《Comprehensive comparative analysis of strand-specific rnA sequencing methods》，寫(xiě)的比較全了

你好！是一種保留方向的RNA測(cè)序技術(shù)，是二代測(cè)序中的一個(gè)比較新的技術(shù)，nature上有一些文章專門(mén)寫(xiě)這個(gè)，你可以看看，也推薦你看看《Comprehensive comparative analysis of strand-specific rnA sequencing methods》，寫(xiě)的比較全了僅代表個(gè)人觀點(diǎn)，不喜勿噴，謝謝。

RNA–Seq 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析法

你都不知道什么意思，還寫(xiě)？換一個(gè)吧

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