常用于一些比較和評(píng)價(jià)指標(biāo)。去掉數(shù)據(jù)的單位限制，轉(zhuǎn)換成無量綱的純值，這樣就可以對(duì)不同單位或數(shù)量級(jí)的指標(biāo)進(jìn)行比較和加權(quán)。最典型的是數(shù)據(jù)的歸一化，將數(shù)據(jù)映射到區(qū)間。數(shù)據(jù)常見的歸一化方法有:minmax 標(biāo)準(zhǔn)化 (minmax歸一化)也叫偏差/12。

對(duì)數(shù)函數(shù)轉(zhuǎn)換也可以通過基于10的對(duì)數(shù)函數(shù)轉(zhuǎn)換的方法來減少。具體方法如下:看了網(wǎng)上很多介紹，都是x*log10(x)，其實(shí)是有問題的。這個(gè)結(jié)果不一定落在區(qū)間上，要除以log10(max)，max是樣本的最大值數(shù)據(jù)，都是。

原文鏈接:數(shù)據(jù) 標(biāo)準(zhǔn)化方法:如何選擇？什么是數(shù)據(jù) 標(biāo)準(zhǔn)化？在進(jìn)行微生物學(xué)數(shù)據(jù)的分析之前，我們往往需要根據(jù)數(shù)據(jù)的不同維度和分析方法的需要，對(duì)-1標(biāo)準(zhǔn)化進(jìn)行預(yù)處理。數(shù)據(jù) 標(biāo)準(zhǔn)化的目的是使數(shù)據(jù)的總體符合一定的要求，例如，使數(shù)據(jù)的總體符合正態(tài)分布以便于參數(shù)檢驗(yàn)，使數(shù)據(jù)的范圍相同以便于比較分析。我們必須了解不同標(biāo)準(zhǔn)化方法的內(nèi)涵，以便在實(shí)際研究中選擇正確的-1標(biāo)準(zhǔn)化方法。

Simple 數(shù)據(jù)變換的意思是簡(jiǎn)單地計(jì)算整個(gè)數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)變換主要有三個(gè)目的。一種是改變數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)，比如用平方根和對(duì)數(shù)把非線性轉(zhuǎn)化為線性；第二，改變數(shù)據(jù)的范圍，便于對(duì)比和圖形分析。比如數(shù)據(jù)變化較大，可以進(jìn)行對(duì)數(shù)變換，縮小屬性范圍；三是改變數(shù)據(jù)的分布，使樣本偏離標(biāo)準(zhǔn)分布太遠(yuǎn)，更接近標(biāo)準(zhǔn)分布(如正態(tài)分布)。常見的數(shù)據(jù)換算如下:對(duì)數(shù)換算:取數(shù)據(jù)(樣本的觀測(cè)值)為自然對(duì)數(shù)(或以其他數(shù)為底的對(duì)數(shù))，可利用log()函數(shù)實(shí)現(xiàn)(log1p()可取數(shù)據(jù)為自然對(duì)數(shù)。

0 EXCEL當(dāng)然簡(jiǎn)單。你可以看看有多少人用EXCEL，但是有多少人知道SPSS是一個(gè)統(tǒng)計(jì)軟件？不知道你說的標(biāo)準(zhǔn)化處理是什么意思，無量綱處理是指對(duì)于一個(gè)數(shù)列N，如果數(shù)列的絕對(duì)值有一個(gè)極限|N|，那么用數(shù)列中的每一個(gè)元素除以這個(gè)極限值n/|N|就得到一個(gè)正負(fù)百分比為n%的數(shù)列，所有的值都在 1的范圍內(nèi)。這叫做無量綱化處理。

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log函數(shù)轉(zhuǎn)換通過以10為底的log函數(shù)轉(zhuǎn)換的方法同樣可以實(shí)現(xiàn)歸一下，具體方法如下：看了下網(wǎng)上很多介紹都是x*log10(x)，其實(shí)是有問題的，這個(gè)結(jié)果并非一定落到[0 標(biāo)準(zhǔn)化的方法是Counts值:對(duì)于給定的基因組參考區(qū)，計(jì)算讀取數(shù)，也稱為rawcount(RC)。Awcount作為原始讀取計(jì)數(shù)矩陣，是一個(gè)絕對(duì)值，絕對(duì)值的特點(diǎn)是基因長度和測(cè)序深度不同，無法比較。因此，我們需要進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化將計(jì)數(shù)矩陣轉(zhuǎn)換為相對(duì)值，以去除基因長度和測(cè)序深度的影響，我們采用解析的方法。標(biāo)準(zhǔn)化獲得了三個(gè)值:rpm(ReadSpermionMappedReads):rpm方法:10 6標(biāo)準(zhǔn)化分析了測(cè)序深度的影響，但沒有考慮轉(zhuǎn)錄本長度的影響。

TCGA的分析大多采用這一結(jié)果。TPM(Transcriptpermillion):TPM percentage):TPM的計(jì)算方法類似于RPKM/FPKM，TPM可以看作是RPKM/FPKM的值的百分比，具體判斷方法:表達(dá)水平是否需要re-標(biāo)準(zhǔn)化。箱線圖函數(shù)可用于觀察樣品表達(dá)豐度值的分布是否整齊，是否需要log2:根據(jù)數(shù)據(jù) value的大小。