從互聯(lián)網(wǎng)走來的Mark提出了互聯(lián)網(wǎng)internet plus)的概念,難免有些自吹自擂。正確的提法應(yīng)該是基因檢測(cè) 互聯(lián)網(wǎng)?;驒z測(cè)技術(shù)是根本,互聯(lián)網(wǎng)只是營(yíng)銷手段。作為本世紀(jì)最具商業(yè)潛力的兩大技術(shù)平臺(tái),兩者的結(jié)合或許能催化下一代大健康領(lǐng)域的獨(dú)角獸企業(yè)。理想很豐滿,但現(xiàn)實(shí)往往蒼白得多。從事基因檢測(cè)的企業(yè)眾多,一些企業(yè)的不良行為往往會(huì)導(dǎo)致消費(fèi)者對(duì)整個(gè)基因行業(yè)的懷疑或不信任,從而嚴(yán)重影響行業(yè)的健康發(fā)展。
5、NGS新技術(shù)分享:單機(jī)一小時(shí)完成WGS全 基因組 數(shù)據(jù)分析近日,SentieonInc與MGI合作,正式推出高通量測(cè)序數(shù)據(jù) Zieon,這是一款一體化的分析機(jī)器。雙方團(tuán)隊(duì)對(duì)華大知止制造的MegaBOLT和Sentieon軟件模塊的性能進(jìn)行了詳細(xì)的討論和測(cè)試,并采用合適的模塊組合推出了Zieon 數(shù)據(jù) analysis一體機(jī)。數(shù)據(jù)說明Zieon可以提高精度,速度提高46倍左右。Zieon是一個(gè)高性能的重測(cè)序分析系統(tǒng),它集成了兩種加速方案,即華大知止制造的MegaBOLT和Sentieon軟件。
通過硬件加速卡、軟件優(yōu)化模塊和多任務(wù)調(diào)度系統(tǒng)加速計(jì)算,與開源的例程流程相比,Zieon可以提高精度,加速約46倍。目前,在高通量測(cè)序/分析過程中已經(jīng)應(yīng)用了包括CPU、GPU和FPGA在內(nèi)的多種計(jì)算架構(gòu),并且這些不同的架構(gòu)對(duì)于過程中不同類型的處理模塊具有不同的效率。
6、什么是 基因, 基因能做什么?生物白明白什么是基因?基因什么事?基因與人類健康息息相關(guān),基因演繹了人類的生老病死等所有生命現(xiàn)象??茖W(xué)研究證明,除了外傷,人類所有的疾病都與基因有關(guān)。所關(guān)注的GTA是基于區(qū)塊鏈、密碼學(xué)、可信計(jì)算、分布式云存儲(chǔ)等技術(shù)基因 數(shù)據(jù)存儲(chǔ)區(qū)塊鏈項(xiàng)目。首先,什么是基因,基因(遺傳因子)是遺傳變異的主要物質(zhì)?;蚴强刂粕镄誀畹幕具z傳單位。
能夠表達(dá)遺傳信息的DNA片段叫做基因,而基因不僅存在于DNA中,也存在于RNA中?;虻墓δ苤饕潜磉_(dá)遺傳特性,記錄和傳遞遺傳信息。主宰生命的基本結(jié)構(gòu)和表現(xiàn)。它儲(chǔ)存了生命孕育、生長(zhǎng)和凋亡的全部信息,通過復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和表達(dá)完成生命繁殖、細(xì)胞分裂和蛋白質(zhì)合成等重要生理過程。生物體的生、長(zhǎng)、病、老、死等一切生命現(xiàn)象都與基因有關(guān)。
7、 基因芯片 數(shù)據(jù)分析-1:使用GEOquery包從GEO獲取 數(shù)據(jù)GEOquery軟件包使用指南GEO(NCBI基因表達(dá)綜合庫(kù))是NCBI用于存儲(chǔ)高通量測(cè)序的專用庫(kù)。如基于芯片數(shù)據(jù)(mRNA、DNA、蛋白質(zhì)豐度)、蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)和高通量測(cè)序數(shù)據(jù)。GEO 數(shù)據(jù)有四種基本類型。樣本、平臺(tái)、系列由作者上傳數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)集由GEO官方整理自數(shù)據(jù)。
芯片的組成信息,如CDNAS、寡核苷酸探針、ORFS、抗體?;蚱渌繖z測(cè)平臺(tái)信息,如SAGEtags、肽。##1.2SamplesGEO編號(hào):GSMxxx描述單個(gè)樣品的信息、處理步驟、處理?xiàng)l件和實(shí)驗(yàn)結(jié)果。一個(gè)樣本可能屬于多個(gè)系列。
8、美國(guó)提出 基因測(cè)序 數(shù)據(jù)分類新標(biāo)準(zhǔn)最近,美國(guó)洛斯阿拉莫斯國(guó)家實(shí)驗(yàn)室(LANL)的一個(gè)遺傳學(xué)團(tuán)隊(duì)和一個(gè)國(guó)際財(cái)團(tuán)聯(lián)合提出了一套質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),旨在澄清公開可用的基因sequencing數(shù)據(jù)information。新標(biāo)準(zhǔn)最終將使基因研究人員能夠開發(fā)出更有效的疫苗,或幫助公共衛(wèi)生部門或安全人員更快地應(yīng)對(duì)潛在的公共衛(wèi)生突發(fā)事件。在《科學(xué)》雜志上,LANL的遺傳學(xué)家Patrick Qian和他的同事提出了6個(gè)基因組測(cè)序數(shù)據(jù)標(biāo)簽,可以根據(jù)其完整性、準(zhǔn)確性和由此產(chǎn)生的結(jié)果對(duì)基因測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分類。
這項(xiàng)成果的重要性在于,研究人員必須每天使用這個(gè)數(shù)據(jù)來交叉引用未知遺傳數(shù)據(jù)和已知生物遺傳數(shù)據(jù),有了這個(gè)新的分類標(biāo)準(zhǔn),獲取和比較數(shù)據(jù)的效率得到了提高。每個(gè)生物體的細(xì)胞中都有DNA,它由四個(gè)分子構(gòu)建模塊(或堿基對(duì))組成,堿基對(duì)按特定順序排列時(shí),可以形成基因。這些基因序列可能包含對(duì)生物體有益或有害的遺傳指令。